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AI开发者做AI新药研发是一种什么体验?周杰龙似乎更有体会 。
2018年, 百度搜索技术创新核心人物之一, 原百度主任架构师周杰龙, 带着一批AI技术骨干实现了一次“跨界”, 创立AI制药企业「望石智慧」 。
将AI用于搜索是周杰龙的强项, 但是如何将AI用于制药环节, 在创立望石智慧之前, 他仍是“一张白纸” 。
没有医药相关的知识储备, 周杰龙选择了一个最笨也最直接的方法——自学 。
围绕细胞学、药物化学、结构生物学、药物设计、有机合成、药理学等方向买了几十本专业书;同时, 积极参加诸多医药领域的学术会议, 与学者探讨人工智能应用到创新药研发领域的可行性 。 ”
在周杰龙看来, 小分子化合物是上帝书写的外语, 而这些化合物与生物大分子靶点的匹配过程就像外语的翻译 。 望石智慧要做的就是用AI帮助药企去‘翻译外语’ 。
经过近三年布局, 望石智慧AI分子设计软件平台已在多个高难度、全新机制或类型First-in-class或Fast-follow项目中取得突破性试验结果 。
上个月, 望石智慧完成总额达1亿美元的B轮和B+轮融资, 是目前AI制药新势力里, 规模最大的创新企业之一 。
近日, 雷锋网《医健AI掘金志》以“AI制药·下一个现象级赛道”为主题, 邀请百图生科、剂泰医药、未知君、望石智慧、英矽智能、星药科技六家先锋企业, 举办了一场线上云峰会 。
作为此次云峰会的报告嘉宾, 望石智慧高级算法专家周文彪就以《AI+药物研发的应用和挑战》为题, 从技术人角度, 对望石智慧的AI制药研发策略做了介绍 。
周文彪表示:从算法角度来看AI制药, 传统药物筛选经常需要在1060分子空间中搜索药物小分子, 这很像机器学习中的最优化过程, 通过最优化算法来将模型训练至一个全局最优处 。
但因为算力问题, 过去药物专家经常通过经验设计小分子再进行筛选, 所以传统药物研发很容易陷入局部最优, 这也就是最早AI介入制药环节的契机 。
而经过学者多年的研究和企业的逐渐深入, AI技术也已经在更多药物研发环节生根发芽 。
以已知参考分子的Me-better的项目为例, AI可以淘汰专家环节, 通过liGANd-based(配体为基)的AI模型生成大量参考分子, 针对某个特定性质、形状、化学性质或药效团, 找到大量优化方案 。
而针对参考分子的first-in-class药物研发项目, AI主要则可以进行更高通量的筛选, 达到10亿级化合物库, 并引入用分子生成方法, 针对某个分子空间特定区域, 密集生成理想分子 。
以下是演讲全部内容, 雷锋网做了不改变原意的整理和编辑:
大家晚上好, 很高兴参加这次雷锋网AI药物研发云峰会 。
首先做个自我介绍, 我之前背景更偏向互联网, 有10年互联网AI算法落地经验, 算是跨界过来 。
今天将更多从AI开发者角度, 给大家搭建一个桥梁, 让AI领域朋友认知到 AI和药物研发的结合意义, 并分享其中的应用与挑战, 主要想从三个方面来分享:
首先, 从药物研发问题出发介绍AI如何在其中发挥作用;
其次, 介绍望石智慧助力药物研发怎么应用AI, 有哪些落地;
最后, 分享对AI+药物研发面临的一些挑战、展望和思考 。

药物研发:锁与钥匙之争先来介绍一下, 药物研发是怎么回事 。
药物原理更类似于一个钥匙, 解开疾病的钥匙, 如何低成本找到这把钥匙, 就是药物研发需要解决的问题 。
而锁就是疾病靶点, 通常我们把它认为是一个蛋白质 。
钥匙小分子插入锁孔就是跟蛋白质发生结合, 可以抑制蛋白质正常作用, 或者激活蛋白质某些作用 。


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