【很多科技公司总部要不是在北京，要不就是在深圳，很少有在上海的？这是什么原因呢？】谢邀！
这是由各自所承担角色和业态确定的 。这里极简的说些 。
北京只点几点，1、中心中的中心 。2、形象象征 。3、虹吸全国各类人材 。4、辐射辽阔 。4、情报来源近在咫尺 。如字节跳动、京东、阿里双中心等等互联网公司 。
深圳，历史上是一个小渔村由改革开放发展起来，定位就是一个窗口，各种新政 验-施地 。1、优先政策 。2、历史上的区位优势，和香港连接，港口城市 。3、前期建设吸引了很多台商、港商，侨胞归来，带来了技术和先进的理念 。4、由于这些建设，成就了整个珠三角完善的生态体系和规模化的产业 。5、包容开放，鼓励创新文化 。这里的阶层流动非常快，对年轻人的吸引正是这里每天都在上演 从身无分文到富豪，从千万富豪到流落街头 。6、榜样的力量 。华为，腾讯，大疆都是从几个人的公司到现在屹立全球的企业 。
上海结构更多元化，偏向于金融，历史上就是亚洲金融中心 。实际上海也有很多科技企业，比如哔哩哔哩，原来的盛大，土豆、大众点评等，隔壁还有阿里巴巴杭州总部 。
总之，北京就像家长，掌握的资源多多 。大哥上海风度翩翩就是一直有钱 。深圳最小，经过奋斗生活越来越好 。

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